Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm28274-202ENSMUST00000187775 1157 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm28202-203ENSMUST00000189780 1157 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Tpt1-ps2-201ENSMUST00000120548 521 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Riok3Q9DBU3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms