Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp12Q9D9M2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms