Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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