Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp5Q9D7S9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms