Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc7Q9D541 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms