Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RTRAFQ9CQE8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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