Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg3Q9CPX6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms