Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rrbp1Q99PL5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rrbp1Q99PL5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rrbp1Q99PL5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rrbp1Q99PL5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rrbp1Q99PL5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rrbp1Q99PL5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rrbp1Q99PL5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rrbp1Q99PL5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rrbp1Q99PL5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rrbp1Q99PL5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms