Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GpnmbQ99P91 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
GpnmbQ99P91 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms