Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1b4Q99ME6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms