Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gins4Q99LZ3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms