Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Sh3bp5lQ99LH9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Sh3bp5lQ99LH9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Sh3bp5lQ99LH9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Sh3bp5lQ99LH9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Sh3bp5lQ99LH9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sh3bp5lQ99LH9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sh3bp5lQ99LH9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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