Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps4Q99KG7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms