Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctu1Q99J10 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ctu1Q99J10 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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