Protein–RNA interactions for Protein: Q99J09

Wdr77, Methylosome protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr77Q99J09 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr77Q99J09 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr77Q99J09 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr77Q99J09 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr77Q99J09 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr77Q99J09 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr77Q99J09 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr77Q99J09 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr77Q99J09 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr77Q99J09 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr77Q99J09 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr77Q99J09 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr77Q99J09 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Wdr77Q99J09 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Wdr77Q99J09 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms