Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trim59Q922Y2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim59Q922Y2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim59Q922Y2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim59Q922Y2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim59Q922Y2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim59Q922Y2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim59Q922Y2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim59Q922Y2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim59Q922Y2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim59Q922Y2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim59Q922Y2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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