Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ttc8Q8VD72 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ttc8Q8VD72 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ttc8Q8VD72 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ttc8Q8VD72 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc8Q8VD72 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc8Q8VD72 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc8Q8VD72 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc8Q8VD72 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc8Q8VD72 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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