Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2A4

Zfp87, MCG140700, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp87Q8K2A4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Zfp87Q8K2A4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Zfp87Q8K2A4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Zfp87Q8K2A4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Zfp87Q8K2A4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp87Q8K2A4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms