Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FgbQ8K0E8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FgbQ8K0E8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FgbQ8K0E8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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FgbQ8K0E8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FgbQ8K0E8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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