Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pkn3Q8K045 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms