Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup88Q8CEC0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms