Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Atg4aQ8C9S8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Atg4aQ8C9S8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Atg4aQ8C9S8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Atg4aQ8C9S8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg4aQ8C9S8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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