Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J6

Sowahc, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SowahcQ8C0J6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SowahcQ8C0J6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms