Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Usp38Q8BW70 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Usp38Q8BW70 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Usp38Q8BW70 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Usp38Q8BW70 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Usp38Q8BW70 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Usp38Q8BW70 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Usp38Q8BW70 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Usp38Q8BW70 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp38Q8BW70 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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