Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms