Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Atg4bQ8BGE6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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Atg4bQ8BGE6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Atg4bQ8BGE6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Atg4bQ8BGE6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg4bQ8BGE6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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