Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Liat1Q810M6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Liat1Q810M6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms