Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim19Q80ZU4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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