Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Topbp1Q6ZQF0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms