Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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NipblQ6KCD5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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