Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp4Q68FH0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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