Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim27Q62158 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim27Q62158 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms