Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctr9Q62018 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms