Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msi1Q61474 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms