Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
JrkQ60976 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
JrkQ60976 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms