Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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