Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trim38Q5SZ99 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim38Q5SZ99 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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