Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sft2d1Q5SSN7 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms