Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp18Q5SSI6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms