Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Trim58Q5NCC9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Trim58Q5NCC9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Trim58Q5NCC9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Trim58Q5NCC9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Trim58Q5NCC9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Trim58Q5NCC9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Trim58Q5NCC9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim58Q5NCC9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms