Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC8.81□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms