Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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D13Ertd608eQ3UPR8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms