Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem253Q3UNB8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem253Q3UNB8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms