Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl2Q3UMU9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms