Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf224Q3UIW8 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms