Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc174Q3U155 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc174Q3U155 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms