Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usp39Q3TIX9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usp39Q3TIX9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usp39Q3TIX9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Usp39Q3TIX9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Usp39Q3TIX9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Usp39Q3TIX9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp39Q3TIX9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms