Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RubcnlQ3TD16 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RubcnlQ3TD16 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms