Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp1aQ2LKU9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms