Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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ptchd1Q14B62 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ptchd1Q14B62 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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